La Institución Educativa San Pablo  fue fundada por la acción comunal del barrio San Pablo en el año 1979 como una sección del IDEM Santo Domingo Savio, del cual se independiza más tarde y toma el nombre de Liceo San Pablo.X

Mediante la resolución departamental Nº 16170 del 27 de noviembre de 2002, se fusionan las escuelas, Urbana Medellín y Marco Fidel Suárez con el Liceo San Pablo, para conformar la Institución Educativa San Pablo compuesta así de tres sedes.

SEDE ESCUELA MARCO FIDEL SUÁREZ:

Fue fundada en 1976 por la Acción Comunal. Está ubicada en la calle 99B Nº37-18, en el barrio Moscú Nº 2, tiene una cobertura aproximada de 340 estudiantes, distribuidos en 5 grupos de transición y 5 grupos de primero.

SEDE ESCUELA MEDELLÍN

Fue fundada en 1967, está ubicada en la calle 96 Nº 36-45 en la parte alta del barrio Villa de Guadalupe. Tiene cobertura para 1100 estudiantes, distribuidos así: 24 grupos de 1º a 5º,  2 grupos de Aceleración del Aprendizaje y 2 de Brújula.

SEDE SAN PABLO

Fue fundado en 1979 por la acción comunal. Está ubicado en la calle 98b Nº 37-38 del barrio San Pablo. Tiene una cobertura aproximada de 1160 estudiantes distribuidos en 36 grupos de la básica secundaria, caminar en secundaria y media académica y técnica en tres jornadas: mañana y tarde (con 30 grupos) y nocturna (tercera jornada con 7 grupos).